被困的殖民者在新卡布里卡的赛昂人残酷统治下挣扎求生，但当卡拉狄加返回拯救人类时，这支羽翼未丰的舰队重新开始搜寻地球。赛昂人在失去对新卡布里卡的控制后，便踏上了前往地球的神秘旅程。

一对濒临离婚的夫妇试图卖掉他们空荡荡的爱巢，然后各自开始新生活。在一次成功的开放参观日之后，他们惊恐地发现，几天后，一个潜在的买家并没有离开他们的家。当爱丽丝被关在地下室时，一位不速之客搬到了楼上。她感觉到她的被囚禁被关押了一段时间……

《太空堡垒卡拉狄加：计划》的剧情讲述的是电视剧中没有交代过的一些事情，故事集中在几个未暴露身份的Cylon身上，将以Cylon人自己的视角，来阐述Cylon对人类实施核灭族的动机和观点。